با این حال، پس از پایان پروژه قهوه تلخ، میان این دو اختلافاتی به وجود آمد. سحر زکریا در چندین مصاحبه اعلام کرد که از برخی مسائل مالی، نحوه برخورد با بازیگران و ادامه همکاری ها ناراضی بوده و همین موضوع باعث فاصله گرفتن او از مهران مدیری شد. او همچنین درباره دعوتش به برنامه دورهمی و برخی مسائل پشت صحنه نیز انتقادهایی مطرح کرده است.

در سال های بعد، این اختلاف ها بارها در رسانه ها مطرح شد، اما گزارش هایی نیز منتشر شد که از احتمال همکاری دوباره آن ها در پروژه ای جدید خبر می داد؛ موضوعی که توجه زیادی را جلب کرد، زیرا بسیاری تصور می کردند اختلافشان پایان ناپذیر است.

با وجود تمام این حاشیه ها، بسیاری از مخاطبان هنوز معتقدند زوج هنری مهران مدیری و سحر زکریا در ساخت برخی از محبوب ترین آثار طنز تلویزیون ایران نقش مهمی داشته اند و همکاری آن ها خاطرات زیادی برای بینندگان دهه 80 و 90 به جا گذاشته است.